船舶专业是哈尔滨工程大学的传统优势专业，学科实力雄厚，承担和参与了大多数现役的海军各类水面舰船、常规潜艇、核潜艇、水中兵器等武器装备的研制，是我国发展海洋高技术的一支重要力量。
王牌专业
国家级特色专业：船舶与海洋工程、轮机工程、热能与动力工程、自动化、核工程与核技术、测控技术与仪器、信息对抗技术
教育部“卓越工程师培养计划”专业：电子信息工程、通信工程、自动化、测控技术与仪器、船舶与海洋工程、核化工与核燃料工程
哈尔滨工程大学
哈尔滨工程大学属于一本，国家重点大学。
哈尔滨工程大学简称“哈工程”，是中华人民共和国工业和信息化部直属并由工业和信息化部、教育部、黑龙江省人民政府、中国人民解放军海军共建的全国重点大学，是国家首批“211工程”、“985工程优势学科创新平台”、双一流“世界一流学科建设高校”。
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